脊髓性肌肉萎缩症(Spinal muscular atrophy, SMA)是一种常染色体隐性遗传病,由脊髓前角运动神经元和脑干运动神经核变性导致肌无力、肌萎缩的疾病,患者逐渐丧失包括呼吸、吞咽在内的各种运动功能,是导致两岁以下婴幼儿死亡的严重遗传病。人群携带率为1/72-1/47,发病率为1/10000-1/6000,该病收录于国家卫生健康委员会等5部门联合制定的《第一批罕见病目录》。
SMA由致病基因SMN1的功能缺失引起,SMN1位于染色体5q13,全长约28Kb,共包含8个外显子。正常人含有两个正常功能的SMN1拷贝,且每条染色体上包含一个拷贝(1+1),而SMA患者中约95%由SMN1基因的Exon7纯合缺失突变所致(0+0),其余5%则伴随异质性SMN1基因的点突变(0+1d)。此外,SMN1的同源修饰基因SMN2的拷贝数增加可以减轻SMA的症状,对于SMA的分型诊断具有重要意义。
而携带者中,约91-94%的人只有一个正常功能的SMN1拷贝(1+0),2-5%的人含有两个SMN1拷贝但其中一个拷贝包含致病点突变(1+1d),另外4%的携带者为沉默型携带者,即有两个SMN1拷贝但都位于同一条染色体上或存在治病点突变(2+0/2+1d)。
安序源四代测序平台具有长读长、高精度、无GC偏好、超低成本等优势,可实现了对SMN1及SMN2基因长片段高效率、高精度测序,可检出SMN1及SMN2基因拷贝数、致病性SNVs及Indels,覆盖0+0、0+1d、1+0、1+1d型。