oligo合成通用载体综述

从上世纪六十年代开始,研究人员对寡核苷酸的化学合成不断完善,最终发展为目前广泛应用的固相亚磷酰胺三酯法。固相合成中,固相载体是必不可少的,正可谓千里之行始于足下,作为oligo合成的起点,固相载体起到了至关重要的作用。

化学合成的寡核苷酸数以万计,每一个oligo的起始碱基不尽相同,如果将每一个起始碱基分别与固相载体修饰连结并不经济高效。显然一种高效经济的通用固相载体可以更好的解决这个问题,随着高通量合成的需求,通用载体发挥着越来越重要的功能。

在高通量oligo合成时,通用载体可以节约更多的时间并有效降低合成错误的可能性。同时针对一些无法在3‘端修饰固相载体的修饰单体也可以通过通用载体连结在oligo序列内。

通用载体1:带刚性双环分子结构的通用载体

目前市售的通用载体普遍采用这种结构,通过在载体上使用刚性双环分子,该分子的构象有助于形成环状磷酸酯过渡态,从而加速去磷酸化的反应速率,相较早期的通用固相载体大大减少了“切割”时间。

但该方法也存在缺陷,在完成oligo合成后,将oligo从固相载体上“切割”时,反应条件较为剧烈,一般为60℃的甲胺和浓氨水溶液反应两个小时或者需要在浓氨水溶液中室温反应12个小时。对于一些含有敏感官能团的oligo合成可能无法承受如此剧烈的条件。

通用载体2:带有(±)-3-氨基-1,2-丙二醇结构的通用载体

2001年,Azhayev小组的研究人员发现使用带有(±)-3-氨基-1,2-丙二醇结构的通用载体,利用酰胺基团形成弱氢键的能力,从而在温和的碱性条件下导致酰胺辅助的去磷酸化。如下图所示:

从而在非常温和的碱性条件下(通常为0.2M氨甲醇溶液)仅需20分钟即可将oligo从固相载体上“切割”。 该种类型的通用固相载体与一些含有敏感官能团,需要温和的脱保护条件的oligo合成完全兼容。

Axbio安序源生物可提供分子生物学常规引物、修饰引物、DNA Oligo定制合成产品;基因测序研发所需的单核苷酸修饰产品及特有官能团修饰类核酸产品。可根据客户需要,订制合成带有特殊标记的引物,也可按照客户要求合成一系列带有特殊官能团的oligo分子。

详询市场部0755-86715032;15813845790(微信同号)

1. A.V. Azhayev, and M.L. Antopolsky, Tetrahedron, 2001, 57, 4977-4986.

2. A.P. Guzaev, and M. Manoharan, J Am Chem Soc, 2003, 125, 2380-2381.

3. R.K. Kumar, A.P. Guzaev, C. Rentel, and V.T. Ravikumar, Tetrahedron, 2006, 62, 4528.

© Copyright 2019 安序源生物科技(深圳)有限公司 All Rights Reserved.